(一)贯穿执行党和国家有关铁路和跨海通道工程建设工作的方针政策、法律法规规章，拟定铁路和琼州海峡跨海通道工程建设发展战略和规划，制定年度计划;研究铁路和跨海通道工程发展的重大政策、法规;指导、协调全省铁路建设及跨海通道工程工作;结合全省国民经济和社会发展战略、规划，研究提出铁路和琼州海峡跨海通道工程的带动项目和配套建设项目。
(二)负责推进铁路和琼州海峡跨海通道工程项目的前期研究工作，承担有关铁路、跨海通道工程项目技术标准及线路方案的研究、评审以及编制项目建议书、可行性报告等各项前期工作;承担项目报批和立项工作。
(三)跟踪推进铁路和跨海通道工程开发、建设过程，协调解决有关重大问题，研究提出相关对策及建议;负责协调与国家部委、相关省市和省内各有关厅局、市县政府及项目业主的工作关系。
(四)承担铁道部、交通运输部和琼州海峡跨海工程前期工作领导小组办公室海南方的日常工作;
(五)承办上级部门交办的其他工作。
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