珠海出入境检验检疫局于1999年8月由原珠海进出口商品检验局、珠海卫生检疫局、拱北动植物检疫局三检合一组建而成，为国家质量监督检验检疫总局的直属机构（正厅级），实行由国家质检总局直接领导的垂直管理体制。
主要职责：
（一）贯彻执行出入境卫生检疫、动植物检疫、食品安全和进出口商品检验法律、法规、规章和政策规定的实施细则、办法及工作规程；负责所辖区域的出入境检验检疫、鉴定、认证和监督管理等行政执法工作。
（二）负责实施出入境检疫查验、传染病监测、卫生监督、卫生处理、卫生检疫行政许可审批、口岸传染病的预防与控制和出入境人员的预防接种、传染病监测体检等工作；配合口岸反恐及相关工作。
（三）负责实施出入境动植物、动植物产品、生物物种资源、转基因生物及其产品和其他检疫物的检验检疫与监督管理；负责动植物疫情监测、调查等工作；承办国家质检总局授权的动植物检疫审批工作，实施动植物疫情的紧急预防措施。
（四）负责实施进出口商品的法定检验和监督管理、进出口商品鉴定；承办所辖区域非法检商品的监督抽查；承办旧机电备案管理；办理进出口商品免验和复验相关工作。
（五）负责进出口食品、化妆品等安全、卫生的监督管理；负责所辖区域出口食品生产企业和出口食品原料种植、养殖基地的备案管理工作；承办国家质检总局授权的进境食用性动物产品检疫审批工作。
（六）负责实施出口商品注册登记；负责实施国家实行许可制度的进出口商品的验证工作；负责对进出口产品认证等工作实施监督管理；负责进口废物原料国内收货人注册登记；负责出口危险货物包装容器质量许可管理；承担进出境动植物及其产品的生产、加工、存放单位注册登记的相关工作。
（七）负责实施出入境交通运载工具、集装箱及容器的卫生监督、检疫监督和有关的适载检验、鉴定；负责实施和管理出入境交通运载工具、集装箱、包装物及铺垫材料和货物的卫生除害处理工作。
（八）负责执行国家、国务院有关部门和国家质检总局的有关检验、检疫的国际协议、协定和议定等；负责辖区内与检验检疫有关的《技术性贸易壁垒协定》和《实施卫生与植物卫生措施协定》的具体实施工作。
（九）负责出入境检验检疫证单、标识和封识的管理；负责出入境检验检疫证书、各类原产地证书的签证工作。
（十）承办质检总局授权的国际动物卫生信息工作，负责国际动物疫情等信息收集、分析、上报；开展所辖区域的出入境检验检疫业务统计分析和进出口商品质量分析，调查和收集国外传染病疫情、动植物疫情和国际贸易商品质量状况，提供相关信息。
（十一）负责对所辖区域内各类进出口检验鉴定和认证机构(包括中外合资、合作机构)以及检疫处理单位、代理报检企业等社会服务机构的监督管理。
（十二）负责出入境检验检疫科技、标准化和信息化工作，承担相关的对外合作与交流工作。
（十三）负责人事管理、教育培训、外事、财务、基建、物资管理、纪检监察、党务、审计、精神文明建设与思想政治工作。
（十四）承办国家质检总局交办的其他工作。
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