新疆维吾尔自治区国家税务局主要职责：
一、贯彻执行国家的税收法律、法规和规章，并结合本区实际，研究制定具体的实施办法。
二、根据生活区经济发展规划，研究制定本系统税收发展规划和年度工作计划并组织实施。
三、根据经济税源和国家税务总局下达的税收计划，编制、分配和下达本系统税收收入计划并组织实施。
四、负责自治区中央税、中央地方共享税等税种的征收管理和稽查工作；负责增值税专用发票、普通发票和其他税收票证的管理工作。
五、负责监督检查本系统的税收执法情况；负责税务行政处罚听证、行政复议和诉讼工作。
六、负责全区进出口税收和涉外税收的管理工作。
七、负责本系统的税收会计、统计工作。
八、负责本系统财务经费、基本建设和资产管理工作，负责审计和系统采购工作。
九、负责本系统机构、编制和人事管理工作。
十、负责本系统思想政治工作、精神文明建设和基层建设，负责教育培训管理工作。
十一、负责本系统的纪检、监察工作。
十二、负责本系统税收信息化、现代化工作的规划和实施，建设和管理信息系统。
十三、研究税收理论和税收政策，分析税收信息，掌握税收动态，组织税法宣传。
十四、承办国家税务总局和自治区党委、政府交办的其他工作。
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