办公室
负责文电、会务、机要、档案等机关日常工作；承担信息、安全保密、新闻宣传、社会治安综合治理工作；承担机关财务、统计、资产管理、综合业务与协调处理等工作。
贯彻执行国家各项财经法律、法规和政策，组织拟订有关财务制度；依法承担国土资源部门的各项行政事业性收费和专项收入征收管理工作；配合有关处室拟订国土资源收益分配制度；负责专项资金管理、部门预算、部门决算、内部审计、政府采购、国库集中支付、国有资产监督管理工作；指导旗县区国土资源管理部门专项收入的征收管理工作。
矿产开发管理科
科学合理利用矿产资源；承担包头市权限内采矿权审批、登记、发证管理工作；编制、划定、实施全市重点矿区矿业权设置方案；负责审核确定应收缴的采矿权价款，依法确定应收缴的矿权使用费；调处重大采矿权权属纠纷；组织采矿权的年度检查工作；组织实施矿产资源储量管理办法、标准、规程、规范；承担发证范围内的矿产资源储量评审备案管理和监督工作；承担本市范围内矿产资源的调查评价和供需形势分析；承担矿产资源补偿费征收管理工作；做好建设项目用地压覆矿产资源申请的初审工作。
规划科
组织编制实施全市国土规划、土地利用总体规划、矿产资源规划，指导各级土地利用总体规划、矿产资源规划建设并实施管理；参与编制和审查土地资源、矿产资源规划的调查评价、土地整理、土地复垦等专项规划；编制管理全市土地利用年度计划，并对执行情况进行监管和评估考核；承担基本建设项目用地及重大专项投资管理的建设项目用地预审工作；负责国土资源综合统计工作；负责国土资源管理相关的科技工作。
地质环境科
组织实施地质灾害防治、地热、矿泉水、地质遗迹(地质公园)资源、矿山地质环境等地质环境保护法规和政策；编制并组织实施相应的地质环境保护规划，组织、协调、指导和监督地质灾害防治工作，拟订并组织实施突发地质灾害应急预案和应急处置；监督实施矿山地质环境保护治理等技术规范与标准；承担古生物化石等地质遗迹保护和地质公园、矿山公园等重要保护区、保护地的监督管理；负责矿泉水、地热水资源开发利用的监督管理；依法管理水文地质、工程地质、环境地质勘察和评价工作。
组织全市矿产资源调查评价，编制地质勘查专项规划，并监督检查执行情况；组织实施全市重大地质勘查专项，负责全市地质勘查项目计划管理与成果效益评估，负责组织探矿权价款评估工作；依法审核矿产资源对外合作区块；依法做好地质勘查争议、纠纷的相关工作。
耕地保护科
负责全市农田保护、农用地转用、土地征收征用和土地整理、土地复垦、土地开发有关政策落实的监督指导；承担对旗县区耕地保护责任目标考核工作；监督检查全市基本农田保护和占用耕地补偿制度落实情况；承办报国务院、自治区和包头市的农用地转用、土地征收征用和土地开发事项的报批工作。
地籍管理科
贯彻落实国家地籍管理办法；监督指导全市土地确权、登记、争议调处工作，调处重大土地权属争议；组织协调各类土地登记资料的整理、共享和汇交工作；组织实施土地调查、监测、统计工作；规范全市土地使用权抵押，指导各旗县区国有土地使用权抵押工作；指导全市地籍工作。
市场管理科
贯彻国土资源市场管理的法律法规方针政策，监督贯彻落实情况；拟订全市国土资源市场管理办法措施，并组织实施；负责制定出让国有建设用地、小型非金属采矿权招标拍卖挂牌出让实施方案，报市政府审批后组织实施；承担集体建设用地使用权流转的有关工作；组织开展土地市场调查和地价调查管理及土地市场地价动态监测工作；承担全市国土资源市场信息发布以及土地和矿业权出让重大事项会审工作。
土地利用管理科
承担全市城乡建设用地管理工作；规范土地使用权的出让、转让、租赁、作价出资(入股)等行为；组织实施土地供应、土地价格、土地资产和土地储备管理政策，编制供地计划；贯彻实施国家土地开发利用标准；承担实施节约集约用地评价和农用地与建设用地分等定级工作，组织实施基准地价、出让地价、标定地价等地价制度及政府基础性、公益性地价的评估；负责建设用地置换的监督管理工作；监督管理土地估价机构及土地估价报告；组织清查和处置闲置土地。
执法监察科(信访科)
组织对土地、矿产资源和测绘方面的法律、法规执行情况进行监督检查；组织实施土地、矿产资源和测绘执法监察及违法案件查处的相关法规；组织查处重大土地、矿产和测绘违法案件，指导执法监察队伍开展执法监察工作，指导全市国土资源执法监察工作；负责来信来访工作。
组织起草国土资源管理的地方性法规规章草案，承担机关规范性文件的合法性审查工作；推进全市国土资源部门依法行政，组织开展行政执法监督工作；承担行政复议、行政应诉、主持听证和相关法规、政策修订的修改与协调等工作；承担国土资源法律法规和政策的宣传工作。
人事科(监察室、精神文明建设办公室)
承担机关及所属事业单位人事、机构编制、离退休人员管理服务和政务公开等工作；负责机关、派出机构及所属事业单位的纪检监察及精神文明建设工作；组织实施干部培训工作；负责目标考核评价工作；负责国土资源系统干部队伍建设工作。
机关党委
机关党委负责机关及所属事业单位的党群工作。
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