江苏省学位委员会委托省教育评估院2013年对南京理工大学化学等25个硕士学位授权一级学科授权点进行评估，结果显示，南理工化学等7个硕士学位授权一级学科点为优秀，南理工的物理学等18个硕士学位授权一级学科点为合格。
江苏省硕士学位授权一级学科点评估的主要内容为：学术队伍建设情况;科学研究情况;教学与人才培养情况;学术交流情况;工作条件及管理工作情况;学生满意度及社会评价情况等。评估范围为包括部省属高等院校、研究院所、军队院校(军事学科除外)、省委党校等培养单位的硕士学位授权一级学科点。
评估结果分为优秀、合格、不合格三个等级。其中优秀等级不超过1/3。评估结果将作为今后省优势学科与重点学科建设，评优表彰，博士、硕士学位授权学科点增列，省研究生培养创新工程项目等方面项目立项的重要依据。
南理工为深入贯彻落实国家和省中长期教育改革和发展规划纲要，切实加强学位与研究生教育的内涵建设，提高硕士学位授权学科点的建设与管理水平，提高研究生培养质量。提出了把握一个主线，深化三项改革，实施五项计划的研究生教育改革发展思路，全面提升研究生教育水平和培养质量。
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