华西临床医学院现有国家重点实验室1个，部、省级重点实验室和研究中心23个;教育部高校重点学科2个，211工程学科建设重点项目3个，卫生部学科重点建设项目9个，省级重点学科15个。下面是华西临床医学院的科室介绍。
中西医科
四川省重点学科， 2008年教育部一级学科评估排名全国第三，2011年获评卫生部国家临床重点专科。现有专业技术人员53人，含正高职称4人、副高职称4人。学科带头人夏庆教授任中国中西医结合学会普外专委会副主任委员，中国中西医结合学会理事。近五年来，开展了腹腔压力动态监测装置在益活清下治疗重症急性胰腺炎中的应用、六合丹外敷技术在急腹症(急性胰腺炎、肠梗阻等)综合治疗方案中的运用等5项全国领先的中医专科特色技术。现有病床142张，下设急腹症治疗、慢阻肺治疗、肿瘤治疗3个临床亚专业及学术研究方向。2011年门诊病人103498人次，住院病人5459人，临床医疗处于国内领先水平。
重症医科
四川省重点学科，在卫生部2010年国家临床重点专科建设项目评估中名列全国第九。现有职工348人，其中专业技术人才343人，含正高职称4人、副高职称12人。学科带头人康焰教授任中华医学会重症医学分会常委，中国医师协会重症医学医师分会副会长。有四个病区，病床132张，下设综合、呼吸、外科、移植、神经、胸心外科、小儿等7个ICU临床亚专业方向。近五年来，共开展全国领先的临床特色新技术18项，其中6项为国内最早开展，挤压综合征的综合技术救治、在ICU支撑下重症胰腺炎患者经后上腰分次引流术2项新技术为国际最早开展或达国际领先水平;同时还开展全国领先的临床新技术、新业务38项，其中国内最早5项。2011年收治各类重症患者6000余例，临床医疗处于国内先进、西部领先水平。该科在5.12汶川地震抗震救灾中功勋卓著，团结和凝聚全国ICU精英，创下世界灾难医学史上一个又一个奇迹，以卓越的表现和优异的成绩受到党和国家领导人的充分肯定、社会的广泛赞誉和国内外同行的尊敬。
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