直属事业单位是直接隶属于核心政府部门，不具有独立法人地位与财务权、人事管理权的单位，直属事业单位所有从业者的待遇均比照公务员。这类事业单位不应考虑经济收入，其活动经费来自财政预算拨款。比如，目前大量的各级政府的政策研究室，如果主要是为政府决策服务，就可以成为直属事业单位。而大量的学校、医院则适合成为独立的事业单位，有些可以实行理事会管理制度。这类事业单位，拥有独立的法人制度、独立的核算权力与人事权力，单位像企业一样由等同于董事会的理事会来监督管理。独立事业单位可以创收，但必须遵循严格的会计、审计和报告制度。
国务院直属单位：
新华通讯社 社长：李从军
中国科学院 院长：白春礼
中国社会科学院 院长：陈奎元
中国工程院 院长：周济
国务院发展研究中心 主任：李伟
国家行政学院 院长：马凯（兼）
中国地震局 局长：陈建民
中国气象局 局长：郑国光
中国银行业监督管理委员会 主席：尚福林
中国证券监督管理委员会 主席：郭树清
中国保险监督管理委员会 主席：项俊波
国家电力监管委员会 主席：吴新雄
全国社会保障基金理事会 理事长：戴相龙
国家自然科学基金委员会 主任：陈宜瑜
国务院台湾事务办公室 主任：王毅
国务院新闻办公室 主任：王晨
国家档案局 局长：杨东权
中国农业发展银行 行长：郑晖
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