该校的历史学专业中世界地区、国别史为国家重点学科，中国近现代史专业为江苏省重点学科，该专业科研教学团队被评为江苏省学科优秀梯队。南京大学中华民国史研究中心为教育部人文社会科学重点研究基地。
设有历史学、考古学两个本科生专业，以及中国近现代史、中国古代史、世界史、专门史、国际关系史、边疆学、考古学7个博士点;考古学与博物馆学、专门史、中国古代史、中国近现代史、世界史、国际关系、民族学7个硕士点。
该系与10多个国家和地区建立了经常性的联系。有多名海外着名教授以及访问学者先后在此讲学交流或攻读博士、硕士学位。举办了中华民国史、中国社会史、当代台湾研究、英国史等国际学术讨论会。
现有教授 31 人(博士生导师 27 人)，副教授 23 人，讲师 5 人，其中国务院政府津贴获得者 11 人，教育部新世纪人才 3 人，江苏省 333工程 4 人，江苏省青蓝工程4 人，南京大学资深教授 2 人。尚有博士毕业待评职称 5 人，其中 1 人为美国杜客大学博士、1 人为日本京都大学博士、1 人为日本九州大学博士。中青年教师有 90%以上曾到美国或英国、加拿大、澳大利亚、韩国、奥地利、意大利进行长期或短期访问，仅赴美国哈佛大学燕京学社访问一年以上者即达 8 人。
就业情况良好，在国家外交部、安全部、新闻机构、高校研究所、部队等单位，都可看到历史学系学生的身影，他们工作勤恳、认真踏实，深受用人单位的好评。现任国家外交部部长杨洁篪和国家档案局局长杨东权就是该系的杰出系友。
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