土木工程系是清华大学历史最悠久的系科之一。早在1916年清华学校(清华大学前身)即开始招收土木工程学科的留美专科生。1928年清华学校更名为国立清华大学，设文、理、法、工四个学院，共16个系，其中有土木工程系。
土木工程包括建筑工程、地下工程、桥梁工程、道路工程、交通工程、市政工程等，土木工程是国家建设的基础，它需要大量高级技术人才。清华大学土木工程系秉承清华大学的优良传统，面向未来不断进取，培养本领域具有创新能力的领袖人才，促进本领域的技术进步。
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