大连理工大学数学科学学院前身为应用数学系，始建于1950年，是新中国建立的第一个应用数学系，当时是在为发展航空事业服务等大背景下成立的。全国性院系调整后，1958年重新成立应用数学专业，隶属数理力学系。1979年应用数学系得以恢复，设应用数学本科专业。1982年开始招收硕士生，1990年在全国工科院校中建立了第一个博士后科研流动站。1998年运筹与控制专业获得博士点授权。2002年计算数学博士点被评为为国家重点学科。2003年获数学一级学科博士点授权。2008年被批准为辽宁省重点一级学科、国家理科基础科学研究和教学人才培养基地。
2009年3月21日，大连理工大学原应用数学系正式更名为数学科学学院，大连理工大学数学科学学院正式成立。至今，本院具有数学博士学位授权一级学科点，涵盖6个二级学科博士点(计算数学、运筹学与控制论、基础数学、应用数学、概率论与数理统计、金融数学与保险精算)。计算数学博士点为国家重点学科。还建有1个博士后科研流动站，2个本科专业(数学与应用数学、信息与计算科学)，正在试办统计学本科专业。
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