水产学院的前身是由著名科学家曾呈奎、朱树屏于1946年筹建创设的山东大学水产系，是我国最早建立的高等水产教育单位。早在六十年代初期就招收过硕士生。文革后继续招收硕士生，并于1984年获得养殖学和捕捞学硕士学位授予权，1985年获得渔业资源学硕士学位授予权，1987年获得水产养殖博士学位授予权，1998年获得渔业资源博士学位授予权和水产一级学科博士点，1999年被批准为水产一级学科博士后流动站。1989年水产养殖学科被评为国家重点学科，在2001年、2004年、2007年三次均以第一名通过国家重点学科评估。经过211和985工程的建设，2007年水产学科(涵盖水产养殖、渔业资源、捕捞学3个二级学科)被评为一级学科国家重点学科。
学院现拥有水产养殖和海洋渔业两个系，设有水产养殖、海洋资源与环境、海洋渔业科学与技术三个本科专业，目前涵盖1个博士后流动站(水产学)、9个博士点和硕士点(水产养殖、水产动物营养与饲料、水生动物医学、水生生物学、动物学、捕捞学、渔业资源、增养殖工程、渔业经济与管理)。学院拥有海水养殖教育部重点实验室、海水养殖教育部工程技术研究中心、水产动物营养与饲料农业部重点实验室、国家级水产科学实验教学示范中心、应用水生生物技术山东省重点实验室等教学科研平台。设有水产养殖长江学者特聘教授岗位、水生生物泰山学者特聘教授岗位、水生生物学山东省重点学科(强化建设)、渔业资源山东省重点学科、水产养殖山东省品牌专业。构建了本科硕士博士博士后的完整的水产学科人才培养体系和培养条件，是国内水产学科人才培养层次最高、最齐全的高等教学单位。
学院现有教职工89人，其中教师62人、正教授31人、博士生导师25人、45岁以下47人、具有海外留学和工作经历的有40余人、具有博士学位者56人占教师总数的90%。现有工程院院士1人、中国科学院院士1人，长江学者奖励计划教授3人，杰出青年基金获得者4人，教育部新世纪人才10人，筑峰人才工程第一层次1人。另外，还有一支定期来校授课和讲学的由中国科学院海洋研究所、国家海洋局第一海洋研究所、中国水产科学研究院黄海水产研究所一批著名专家学者以及由我校海外教授团为主体的国外知名学者组成的高水平客座教师队伍。目前，一支由固定人员和流动人员相结合、国内与国外相结合的、以中青年学术骨干为主体的高水平师资队伍已经形成，在水产学科建设中继续发挥主力军的作用。
近5年来，我院共承担各级科研课题110余项，总经费7390余万元。 其中国家级课题80余项，省部级、市级和横向课题30余项。获得国家和省部级科技奖励近20项，国家自然科学二等奖1项，国家科技进步二等奖2项，国家技术发明二等奖1项。近五年我院共受理国家专利110余项，其中发明专利90余项，实用新型专利20余项。主编并出版校级规划教材2部;主编和副主编国家规划教材3部，出版实验教材6部，教材参考书5部。共发表论文600余篇，其中SCI和EI收录400余篇，居全国水产院校首位。
水产学院本科生考取研究生的比例连续三年达50%以上，一次就业率90%以上。目前，水产在校生现有1108人，其中本科生598人，硕士研究生345人，博士研究生165人。
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