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目前尚无特效抗病毒治疗药物，早期可试用利巴韦林、干扰素，重点处理危重症。对症治疗为主。
高热处理
以物理降温为主(降温不宜过快、过猛，禁用冰水擦浴，以免引起寒战和虚脱)，药物降温为辅(应防止用药过量致大量出汗而引起的循环衰竭)，同时降低室温。亚冬眠疗法：适用于持续高热伴反复抽搐者，具有降温、镇静、止痉作用，肌注氯丙嗪和异丙嗪，因有抑制呼吸中枢的作用，故应保持呼吸通畅。
抽搐处理
去除病因及镇静止痉，若因高热引起，则降温为主;若因脑水肿所致，应加强脱水治疗;若因脑实质病变则使用镇静剂，常用地西泮，亦可采用亚冬眠疗法，巴比妥钠可预防抽搐。
呼吸衰竭处理
去除病因对症治疗。氧疗;因脑水肿导致应加强脱水治疗;因呼吸道分泌物阻塞者应定时吸痰、翻身拍背，必要时用化痰药物和糖皮质激素雾化吸入，必要时行气管插管或气道切开;中枢性呼吸衰竭时可使用呼吸兴奋剂，首选洛贝林，亦可用尼可刹米;改善微循环，使用血管扩张剂，如东莨菪碱、阿托品、酚妥拉明，可改善脑微循环、减轻脑水肿、接触脑血管痉挛和兴奋呼吸中枢。
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