重庆市綦江区卫生局主要职责：
(一)贯彻执行国家、市有关卫生工作的方针、政策、法律、法规以及技术规范和卫生标准。
(二)推进全区医药卫生体制改革，研究拟订全区卫生改革与发展总体规划，统筹规划与协调全区卫生资源配置，承担区域卫生规划的编制和实施。
(三)负责实施国家、市基本药物制度。
(四)组织拟订并实施全区农村卫生、社区卫生、妇幼卫生发展规划和政策措施，规划并指导农村卫生、社区卫生服务体系建设，负责妇幼保健、初级卫生保健和母婴保健专项技术的综合管理和监督。协同计生部门做好全区计划生育技术服务的质量监督和业务指导工作。
(五)贯彻预防为主方针，开展全民健康教育，负责疾病预防控制工作，拟订实施重大疾病防治规划，拟订全区免疫规划及方案，协调有关部门对重大疾病实施防控与干预，组织对重大疾病的综合防治，组织调度全区卫生技术力量，协助当地政府对重大突发疫情、病情实施紧急处置，防止和控制疫情、疾病的蔓延，报告传染病疫情信息。承担区防治艾滋病工作委员会的具体工作。
(六)负责卫生应急工作，拟订卫生应急预案和政策措施，负责突发公共卫生事件监测预警和风险评估，指导实施突发公共卫生事件预防控制与应急处置，发布突发公共卫生事件应急处置信息。
(七)执行促进中医药事业发展的法律、法规、规章和政策，拟定中医药中长期发展规划，并纳入全区卫生事业发展总体规划和目标。
(八)指导规范卫生行政执法工作，负责职业卫生、放射卫生、学校卫生、公共场所、生活饮用水卫生和医疗市场等的安全监督管理和相关项目的许可，监督管理传染病、地方病、职业病防治。
(九)负责全区医疗机构医疗服务的全行业监督管理，督导医疗机构在医疗服务、技术、质量等方面执行相关政策、规范和标准，组织拟订医疗卫生职业道德规范，建立医疗机构医疗服务评价和监督体系。依法监督管理采供血机构采血及临床用血质量。
(十)组织拟订全区医学科技、教育发展规划，搭建医学科研平台，指导医学科技成果的普及应用，负责规划、组织卫生系统干部职工的培训和继续教育工作。
(十一)指导卫生人才队伍建设工作，拟订全区卫生人才发展规划。
(十二)负责区干部保健委员会确定的保健对象的医疗保健工作，负责全区重要会议与重大活动的医疗卫生保障工作。
(十三)承担区爱国卫生运动委员会和红十字会的具体工作。
(十四)承办区委、区政府和上级部门交办的其他事项。
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