沈阳市地方税务局棋盘山分局下设六个科室，分别为办公室、综合业务科、计划征收科、检查科、棋盘山税务所、高坎税务所。其具体职能为：
1、办公室
处理局机关政务工作；负责文秘、档案、信访、保密、督查督办、信息、税收宣传和建议提案的办理；负责行政后勤管理、安全保卫和接待服务工作；负责人事、劳动工资管理；负责干部的学历教育、专业证书和业务培训；负责精神文明建设和思想政治工作；负责纪检和行政监察工作；负责党群工作；负责离退休干部管理工作。
2、综合业务科
负责征管制度的制定完善和组织实施；负责税务登记、纳税申报、发票管理；负责外出经营活动税收管理证明的管理；负责代扣代缴、委托代征及协税护税管理；负责帐簿、凭证管理和定期定额及定率管理工作；负责延期缴纳税款管理；负责对征收、稽查、处罚等各项执法程序的确立和指导；负责税收征管档案管理；负责协调管理质量考核工作；负责税务稽查的选案；负责受理一般举报案件；负责协调开展评税委员会、涉税违法案件审理委员会等项工作；负责地方税收税政业务的解答、调研；负责地方税收减免税的审核上报；负责执法监督检查；负责税务听证、诉讼及复议；负责编报征管、税政报表；负责地方各费、基金政策业务管理。
3、计划征收科
负责税收计划、税收会计、税收统计和税收票证管理；负责税源调查和监控；负责地方税收的提退、清欠管理工作；负责结算代扣代缴、委托代征手续费；负责财务、经费、固定资产和专项资金管理；负责装备管理；负责编制、审核财务预算、决算，办理各项经费领拨；负责内部审计工作；负责编报会统报表；负责受理纳税申报；负责税款、滞纳金、罚款的征收和销号；负责当期税款催报催缴及相应违章处罚；负责受理纳税担保；负责税法公告；负责征收和管理环节涉税申请的受理、传递和送达相关税收法律文书；负责计算机硬件、软件及网络的管理和维护；负责全局涉税信息的采集录入管理；负责具体办理税务登记、发票审批发售、政策咨询等窗口业务；负责编报征收报表。
4、检查科
负责日常稽查，根据上级部署开展专项稽查，负责一般案件的专项稽查；负责税务处理决定书送达及相应查补税款、滞纳金、罚款的追缴入库；负责实施税收保全措施和强制执行措施；负责与公、检、法等司法机关的工作协调。
5、棋盘山税务所
负责辖区内个体工商户、专业市场、零散税收的征收管理。具体包括：负责纳税申报，税款、滞纳金、罚款的征收，发票管理工作；负责定期定额纳税人的定额定率核定和调整的执行；负责税法宣传；负责涉税申请受理，有关税收法律文书的送达；负责管户的税务稽查；负责编报征管和会统报表；负责本辖区内各种注册类型纳税人的户籍监控管理；负责开业税务登记的验点工作；负责漏管户的清查和税务登记督办工作；负责纳税人纳税申报、欠缴税款、滞纳金、罚款的催报催缴及相应处罚工作；负责协税护税。
6、高坎税务所
负责辖区内个体工商户、专业市场、零散税收的征收管理。具体包括：负责纳税申报，税款、滞纳金、罚款的征收，发票管理工作；负责定期定额纳税人的定额定率核定和调整的执行；负责税法宣传；负责涉税申请受理，有关税收法律文书的送达；负责管户的税务稽查；负责编报征管和会统报表；负责本辖区内各种注册类型纳税人的户籍监控管理；负责开业税务登记的验点工作；负责漏管户的清查和税务登记督办工作；负责纳税人纳税申报、欠缴税款、滞纳金、罚款的催报催缴及相应处罚工作；负责协税护税。
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