志贺菌属的细菌，通称痢疾杆菌，是人类细菌性痢疾的病原菌，以病人和带菌者为传染源，无动物宿主。
志贺菌属致病物质主要是侵袭力和内毒素，有的毒株还可产生外毒素。
(1)侵袭力：无论是产生外毒素还是产生内毒素的志贺菌，必须侵入肠粘膜才能致病。如何粘附粘膜表面对志贺菌的致病性起决定作用。志贺菌的毒性作用是通过菌毛粘附侵染于回肠末端和结肠粘膜的上皮细胞，在胞内繁殖，在细胞间扩散，以增大感染病灶而导致上皮层的溃疡和破坏，引起炎症反应。编码侵袭力的质粒，至少包括四个基因：IpaA、IapB、IpaC和IpaD，它们编码一系列蛋白，与细菌的毒性有关。它们的作用是双重性的，如IpaB即作为传递物引发细胞的吞噬作用;又可作为细胞溶解素使志贺菌脱离吞噬细胞，引起一系列的局部炎症反应。引起出血性的脓血粘液便，细菌侵入血流罕见。由于该菌属于侵入性细菌，故而只需几个、十几个菌即可引起痢疾的发生。
(2)内毒素:志贺菌有强烈的内毒素,内毒素作用于肠壁，使其通透性增高，进一步促进内毒素的吸收，引起全身中毒症状如发热、神志障碍，溶血性尿毒综合症(HUS)，甚至中毒性休克。内毒素作用于肠壁植物神经系统，使肠道功能紊乱、肠蠕动共济失调和痉挛，尤其是直肠括约肌痉挛最明显，因而发生绞痛，里急后重等症状。内毒素还作用于粘膜上皮细胞，使其失去吸收能力而造成腹泻。内毒素破坏粘膜,形成炎症、溃疡,呈现典型的脓血粘液便。
(3)外毒素：亦称志贺毒素丁志贺毒素具有三种生物学活性:肠毒素性、细胞毒性和神经毒性,肠毒素性具有肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)和霍乱弧菌肠毒素的活性，引起水样腹泻。细胞毒性对人肝细胞、猴肾细胞和Hela细胞均有毒性。毒素的活性中心作用于60s核糖体而抑制蛋白质的合成，杀死肠道上皮细胞。神经毒性可作用于中枢神经系统。
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